Podobnie jak poprzednim razem, w sezonie 3 zrealizowano siedem tygodni emisji i zarazem terapii (35 odcinków), zaś akcja dzieje się rok po wydarzeniach z sezonu drugiego. Andrzej spędził ten czas w Wiedniu, w mieszkaniu odziedziczonym po zmarłym ojcu, ale teraz wraca do Polski, aby z rekomendacji Barbary zostać dyrektorem renomowanego Centrum Psychoterapii „Kronos” w Warszawie. Oprócz kierowania placówką przyjmuje też pacjentów. W życiu osobistym zmaga się z niełatwymi relacjami z najmłodszym synem, który nie chce mieszkać z byłą żoną terapeuty i jej nowym partnerem, więc wprowadza się do ojca. Andrzej musi też podjąć decyzje w sprawie dalszych losów swej relacji z kobietą, którą poznał w Wiedniu.